荷兰总督府建筑在热兰遮城中心，规制到也不大，也只抵的上内地一个小县的县衙门大小，只是纯粹的西方式建筑让周围戒备巡逻的台北士兵们觉得稀奇的紧，此时天已大亮，守在总督府的张鼐见张伟带着人远远过来，便喝斥那些看热闹的兵士道：“混帐，还不快些打扫，把这些尸体抬走，血迹用水冲洗干净！”
张伟自城头而下，一路上便可看出昨夜巷战的惨烈，一路上横七竖八，尽是那荷兰士兵与平民的尸体，鲜血流遍整个街道，看着这些金发碧眼的白人身着十七世纪时的装束，死在了离家乡万里的中国，张伟心中却突然想起自已那个时代的荷兰“三剑客”，心中暗道：“三剑客，叫起来好听，可惜，你们总归是和铁与火无关的民族啊。”
待行到总督府前，见张鼐站在总督府前的台阶上，正带着一群校尉、果尉迎候自已，张伟笑道：“咱们何必弄这些虚礼，你们打了一夜，还在这儿站什么班？都快回屋里，自个儿寻地方坐着，没的把自个弄的跟门神似的。”
说罢打量这座西方哥特式建筑，见正门外四处是火枪铁丸击中的小弹洞，转头问周全斌道：“此处便是荷人拒守的最后堡垒吧？”
“正是。待总督府被咱们攻下来，整个城内的抵抗便小了很多。”
说完又恨道：“咱们的士兵，也是于此处死伤最大，他们依托坚固的总督府建筑，在房内向外打枪，还是咱们的飞骑硬顶着伤亡方冲了进去，所以才会死伤那么许多。进去之后，里面的人纵是举枪投降，也被各人砍了个干净。”
张伟听到此处，到也没有什么话说，他原本是用“不杀降者”来约束诸卫，但战争打到这种激烈的程度，约束着兵士不砍荷兰人，难不成砍自已人么？所谓不杀降，只是用来诱惑那些意志不坚，在降或战之间徘徊的敌人罢了。
当下由张伟领头，先进了这总督府内，至四处打量了一番，却也没有什么豪华出众之处，只是那揆一住处稍微装潢一下罢了。张伟略翻了一下，却也没有发现什么女人的用具和衣裤，料想那揆一没有带夫人来台。见校尉以上已然都至总督府报道，张伟便令人将总督府内会议室重新打扫部置，便在那会议室召开会议。
那林兴珠见室中皆是自已的上司，自已贸然随张伟进来，一时却也不好出去，便推说身上有伤，只是侍立在张伟身后，张伟肚里暗笑，却也不去说穿他，见各人都已坐定，便笑道：“各位，昨晚可是辛苦了大家。除了林都尉外，可有都尉以上受伤的？”
张鼐与张瑞周全斌三人齐声道：“除林都尉外，其余只是阵亡了三个果尉，别无将官死伤。”
说罢诸人都笑看林兴珠，张伟见他有些窘迫，忙道：“林都尉昨晚率五百壮士，在敌军枪口下挖洞，炸开城墙，昨夜首功，便是林都尉！”
说罢又令各卫参军报上详细死伤数字，核对人名，又令将死者抬上港口船只，即刻运回台北，令人通报何斌，好生抚恤。
诸将弄了半天的死伤名册，这些士兵大多是众人带了数年的手下，多半看了名字便可以想起相貌，想到前几日还活蹦乱跳的大活人，今日已成黄泉陌路之鬼，各人都是眼眶通红，几欲落泪。
张伟亦是心疼之极，算来自大员、海上炮战、登陆台南之后，已有数百人死，过千人伤，虽说来自已并无指挥失败之处，那郑成功攻台登陆台南，头一日便有六七百兵死于炮击，敌守我攻，死伤自是难免。只是心中虽明白此节，却仍是难以抑制悲痛，当下将手一撑，站将起来，对诸将道：“那揆一和被俘的荷人都押在何处？”
张瑞回道：“都押在城西。已派了飞骑看守。”
张伟怒道：“咱们这便去，处置了这帮混帐！”
众将也正是火大之时，听张伟如此一说，各人顿时便站起身来，待张伟出门，一群人便也杀气腾腾跟随他身后，向城西看守俘虏之处而去。
待行到城西，只见那男女老幼近三千荷人被押在一处空地上，各人都是神情萎靡，疲惫不堪，见一群人过来，显是这中国军队的高级将领，各人不知道将会如何发落自已，又是担心，又是害怕，那胆小的便开始发起抖来。
揆一在城头晕了半天，待醒来后搀扶他的士兵早已溜的踪影不见，待他晕头涨脑起身，身边却早便围了一圈台北士兵，见他衣着华丽，立时便有一果尉便十几人将他看的严严实实，待天亮寻了翻译来问，方知这个晕倒在地的胖子原来就是这台北总督。
此时他却没有得到什么特殊待遇，与那几百名被俘的荷兰士兵垂头丧气的坐在一处，待张伟行到他身前，身边的看守士兵便喝令他抬头，他虽听不懂，却见一帮军官模样的人都拥在张伟身边，自然也知道眼前的人便是此次中国军队的首领，茫然抬头，向张伟说道：“阁下要怎么处置我们？身为一个绅士，绝不会虐待他的战俘。”
张伟听得他如此说，不觉仰首大笑，半响才恶狠狠的回他道：“总督先生，我好意派人来劝降，你很没有风度的将我的使者驱赶出城，自那时起，你们便失去了投降及受到友好待遇的机会，现下，我向你宣布，除了贵国平民外，所有的士兵，包括您，总督大人，都得接受我的严惩，我要让你们的东印度公司明白，和我做对，得到的下场将会非常凄惨！”
说到此处，张伟转身向张瑞道：“张瑞，你速带人立树杆，挂绞索，这些红毛
鬼处决犯人皆是用绞刑，咱们今日，便也用他们的刑法，将这位总督大人绞死！”
说罢便转身上城，只待张瑞出城门将绞台弄好，便向揆一冷笑道：“总督先生，请上路罢！”
揆一一见张瑞命士兵扛来一根旗杆，又见人在杆头上绑上绳子，打上死结，心中早已明白要处死的便是自已，待翻译将张伟的话译了给他，立时便把他吓了个半死，抖抖索索的想要站起，以便不失他总督及优异白人血统的身份，谁料那两腿却怎么也不听指挥，只顾抖了半响，用手死命撑了半日，却如何也爬不起来。张伟见状冷冷一笑，便挥手命兵士帮他站起，一直拉到那绞索面前，直到绳结套在揆一脖子上那揆一却突然说道：“先生，请饶我一命，我愿意去命令大员岛上的普罗岷西亚城投降！”
张伟及身后诸将听那翻译将揆一的话译了出来，不禁面面相歔，此人胆小无耻当真是常人难及，若是依了他，心中愤恨难平，若是不依，打那大员岛却又得多费周章，张伟在心中忖度一番，始终觉得此事利大于弊，便向张瑞令道：“此人这般怕死，却也能省了我们许多事。你立时带人押他去大员，带他到普罗岷西亚城外招降，若是成了，令刘国轩将岛上所有人等押来台南，若是不成，便在城外将揆一毙了，回来报我。”
说罢，便由张瑞押着揆一去大员招降不提，张鼐见张伟目视眼前的这些士兵与荷人平民，便凑上前去，说道：“大人，那揆一有些用处，不杀便是了。这些士兵和老百姓可没半点用，昨夜打死了咱们那么多兄弟，干脆将这些人尽数杀了，好给兄弟们报仇。”
周全斌原本便对张伟要处死揆一并不赞同，见揆一临刑保命，他却正是舒服口气，又听张鼐向张伟如此建议，忙上前道：“大人，杀俘不祥，请您三思。”
张鼐气道：“全斌，难道死了弟兄你不心疼么？”
周全斌也怒道：“我怎地不心疼？都是跟我多年的兄弟，我的亲兵小武昨日也战死了，难道我没有你们心痛么！只是这些兵士也有家人父母，若是战死也罢了，现下都丢枪投降，若是杀了，咱们成什么人了！”
又向张伟道：“更何况，那荷兰人在南洋颇有实力，咱们若是杀了这么许多俘虏，他们必定会拼命来袭，这却又是何苦？”
张伟原本举旗不定，心中也是不忍杀这么许多，听周全斌如此相劝，反倒拿定了主意，向周全斌道：“全斌，我知道你素来心软，只是这些人拒不投降，打死我众我优良士兵，我实痛恨！况且，我就不杀，那荷兰人也绝不会就此罢休，想来还是会派军舰前来试探，调大兵么，整个南洋他们也没有多少步兵，杀了这些人，他们也无可奈何，杀之，反倒能震一震后来之人，莫要不知死活，于我相抗！”
见周全斌仍要相劝，张伟笑道：“我知你实在是不忍心，这样，我不全杀，这些兵士亦是受人指使罢了，只需依军服样式，将所有军官拖出来毙了，也就是了。”
说罢不待周全斌开口，立时命人在五百多降兵中拖出数十名军官来，张伟一努嘴，张鼐便命人将军官押到空地一侧墙角，每十人一组枪杀，不消片刻，枪声响起，第一排的军官纷纷中弹倒地，鲜血慢慢流将下来，场中荷人又惊又惧，更有不少妇人痛哭起来。待军官杀尽，那执行的都尉回来履命，张伟命翻译去训话道：“杀这些人，是为了给你们荷兰人一个教训，若是还敢来台，所有军人，不论是军官士兵，一律枪毙！”
待枪杀完毕，张伟令人给这些荷人送上饮水粮食，自带人回总督府等候张瑞消息。一直到下午时分，却见张瑞押着揆一返回，张伟听人进来报了，向众将笑道：“此事战事暂且是打完了。”
待张瑞进门，先行了一礼，正要禀报，张伟先笑道：“张瑞，可是那揆一将大员岛劝降了？”
张瑞亦笑道：“正是！那揆一到了城下，先是哀求，后来发怒，拿出了总督的身份下了命令，道是不战而降，他们没有责任，战而后败，不死也要他们的东印度公司追究他们违命之责。那城内的将军因见咱们已打下台南，想必那普罗岷西亚城也是守不住，见揆一将责任尽数揽了去，便也半推半就，开城投降了。刘统领已留了人在大员驻守，却命我带了人将城中俘虏尽数带到台南来了。”
“甚好！”张伟附掌道：“善哉，不动刀兵而下一城，也算那揆一立了一功，命人在城中寻一处房子，将他好生看押。待日后再做处置。”
说罢又向身边随侍的行军司马令道：“将咱们的兵士尽数迁到城内来住，命施琅带着水师进驻台南港口，用帐篷搭起营地，关押荷人战俘。”
至此台南平定，除了防备荷人自南洋派兵来袭外，整个台湾全岛已纳入张伟掌控，张伟在台南又待了十数日，将台南立为长安与万年两镇，留施琅水师防水路，留周全斌领神策卫防陆路，兼领民政，留刘国轩领兵守大员，自已带了伤兵及金吾卫、飞骑，乘船回台北而去。
临行叮嘱施琅，若是荷人军舰来袭，水师不必出动，只需大员岛上岸炮及热兰遮城上大炮协助防守，那荷人军舰抓不到机会，自然会懈怠，待耗上一段时间，再相机出动，一战将荷军撵跑，到那时，荷人自然会至台北寻他谈判。